未来相当长一段时间内，三元母猪将是家庭农场的主要种源，因此如何做好三元母猪的选留将成为家庭农场复产过程中的一项重要工作。
1. 选留原则
三元母猪选留仍然遵循母猪选留的基本原则，即：
第一：选种就是选健康（主要包括肢体健康、肠道健康、无呼吸道病史）；
第二：选种就是选繁殖性能（三元母猪繁殖性能主要通过外观形状来体现）。
2. 选留数量
1、闭环生产状态下分阶段选留一定数量：可分为哺乳期选种、保育期选种、育成期选种，按母猪年更新率30%，哺乳期成活率80%，保育期成活率90%，育成期成活率95%，年平均生产胎次2胎计算，原200头存栏母猪场（非瘟背景下存栏为满负荷生产状态下的80%），则：
育成期需要选留：200*0.8*0.3/0.95/2≈26头
保育期需要选留：26/0.9≈29头
哺乳期需要选留：29/0.8≈36头
2、清空状态下复产引进种猪数量参考育成期选留数量，且建议引进体重以100kg为宜。
3. 选留标准
对1-3日龄产房仔猪进行初选，并做好耳缺标记，具体如下：
初生重：1kg以上；
乳头数：有效乳头数5对以上，且间距均匀；
同窝无遗传缺陷：如脐疝、兔耳朵和八字脚等；
活力要求：强，吃奶能力强；
繁殖性能：窝产总仔在8头以上，外阴正常。
初选仔猪断奶后分开单独饲养，60-70日龄仔猪，进行二选，具体如下：
背部平直，外观符合品种特征；
肢蹄结实，无运动障碍；
健康活泼，无明显疾病；
乳头数：有效乳头数5对以上，且间距均匀；
生长发育正常、生殖器官发育良好。
体重50-60kg进行三选，具体如下：
体型：尽量高、长、肩宽，腹部良好有曲线，臀部宽平；
乳头数：有效乳头5对以上且均匀；
肢蹄：肢蹄健壮，无明显肢蹄疾患；
外阴：大小及形状正常，不上翘；
肤色：被毛关泽、皮肤色泽正常无花斑；
健康：状况良好，无呼吸道疾病史。
4. 非瘟检测
非瘟背景下建议配种前21天即在第一次发情或第二次发情时进行采样进行敏感病原检测，要求：
第一：抗原检测必须为阴性，表明未感染或曾经感染但已清除体内病毒；
第二：抗体检测阴性或阳性，表明未感染或已康复；
第三：耐受过程中无明显特征性症状，如持续发热、跛行、耳朵及周身发绀、严重呼吸困难等，反应其内部组织器官无严重病变，对后期生长及繁殖性能无限制性影响。

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